Extra Informatie:
Deze test kan enkel aangevraagd worden na contact met de microbioloog van dienst.
Vermeld alle beschikbare informatie op het verzendformulier:
- staaltype
- reden analyse (bijvoorbeeld: vermoeden PJI met negatieve kweek/positieve haemocultuur, niet in groei te brengen/geen identificatie m.b.v. de MALDI-TOF)
- resultaat gramkleuring
Methode: bacteriële identificatie met behulp van nanopore sequencing van het volledig 16S rRNA gen
Beperkingen van de test:
- Het taxonomisch niveau van de identificatie is afhankelijk van de variabiliteit van het 16S gen binnen het desbetreffend taxon.
- Rapportering op speciesniveau steeds onder voorbehoud, waarbij het meest waarschijnlijke species wordt gerapporteerd.
- Omwille van onvolledige primer complementariteit is deze test niet geschikt voor het opsporen van bacteriën binnen de orde Chlamydiales, en is er mogelijk verminderde gevoeligheid voor het genus Borrelia. Hiervoor kunnen echter wel gerichte PCR's worden gebruikt. Neem contact op met de microbioloog bij hoge klinische verdenking.
- Bij vermoeden van een infectie met atypische Mycobacteriën, contacteer de microbioloog voor bijkomende sequencing van het hsp65 target.